Des del primer cas de malaltia per coronavirus, el desembre de 2019, la malaltia pandèmica s'ha estès a milions de persones a tot el món.Aquesta pandèmia global de la novel·lasíndrome respiratòria aguda severa coronavirus 2 (SARS-CoV-2)és una de les crisis de salut global més convincents i preocupants de l'actualitat, que suposa grans amenaces per al món i afecta tots els aspectes de la vida humana.[1]
Els coronavirus són virus d'ARN envoltats, de sentit positiu i monocatenari de la família Coronaviridae, que tenen un ampli espectre d'hostes com humans, ratpenats, camells i espècies d'aus, inclòs el bestiar i els animals de companyia, que representen una amenaça per a la salut pública. 1 Els coronavirus es classifiquen a la subfamília d'Orthocoronavirinae, que es divideix a més en quatre gèneres, en funció de les diferències en les seqüències de proteïnes: a-coronavirus, b-coronavirus, g-coronavirus i d-coronavirus.Els a-coronavirus i els b-coronavirus només infecten mamífers, mentre que els g-coronavirus i els d-coronavirus infecten principalment ocells, tot i que alguns d'ells poden infectar mamífers.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV i SARS-CoV-2 són els set coronavirus que s'han identificat per infectar humans.Entre ells, SARSCoV i MERS-CoV, que han sorgit a la població humana el 2002 i el 2012, són altament patògens.Mentre que les soques de coronavirus humà (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 o HCoV-HKU1 que circulen a la població humana només causen el refredat comú,7 la síndrome respiratòria aguda severa coronavirus 2 (SARS-CoV2), l'agent causal de COVID-19, és un nou coronavirus b, que va aparèixer a finals del 2019 i ha provocat morts devastadores.Els símptomes primaris deCOVID 19són similars als del SARS-CoV i MERS-CoV: febre, cansament, tos seca, dolor toràcic superior, de vegades diarrea i dispnea.A diferència del passatinfeccions per coronavirus (CoV)., la ràpida difusió global, l'alta taxa de transmissió, el temps d'incubació més llarg, les infeccions més asimptomàtiques i la gravetat de la malaltia del SARS-CoV-2 requereixen un coneixement profund sobre les estratègies d'evasió immune viral.
Igual que altres coronavirus humans (SARS-CoV-2, MERS-CoV), SARSCoV-2 també té un genoma d'ARN de sentit positiu monocatenari d'uns 30 kb de mida.Com es mostra a la figura 1, les proteïnes de la nucleocàpsida viral (N) agrupan el genoma en un gran complex de ribonucleoproteïna (RNP), que després està embolicat per lípids i proteïnes virals S (espiga), M (membrana) i E (embolcall).L'extrem 50 del genoma té dos grans marcs de lectura oberts (ORF), ORF1a i ORF1b, que codifiquen els polipèptids pp1a i pp1b, que es produeixen en 16 proteïnes no estructurals (NSP) que impliquen tots els aspectes de la replicació viral per part de les proteases virals NSP3 i NSP5 que alberguen. un domini de proteasa semblant a la papaïna i un domini de proteasa semblant a 3C, respectivament.9 L'extrem 30 del genoma codifica proteïnes estructurals i les proteïnes accessories, de les quals s'ha demostrat que ORF3a, ORF6, ORF7a i ORF7b són proteïnes estructurals virals implicades. en la formació de partícules virals i ORF3b i ORF6 funcionen com a antagonistes de l'interferó.Segons l'anotació actual sobre la base de la similitud de seqüències amb altres b-coronavirus, el SARS-CoV-2 inclou prediccions de sis proteïnes accessories (3a, 6, 7a, 7b, 8 i 10).Tanmateix, encara no tots aquests ORF s'han validat experimentalment, i el nombre exacte de gens accessoris del SARS-CoV-2 encara és un punt de discussió.Per tant, encara no està clar quins gens accessoris s'expressen realment per aquest genoma compacte.[2]
Les proves molt sensibles i específiques són crucials per identificar i gestionar els pacients amb COVID-19, així com per implementar mesures de control per limitar el brot.Les proves moleculars de punt d'atenció (POC) tenen el potencial de permetre la detecció i l'aïllament més precoç dels casos confirmats de SARS-CoV-2, en comparació amb els mètodes de diagnòstic basats en laboratori, reduint així la transmissió domèstica i comunitària.
[1] Impacte clínic i operatiu de la detecció ràpida de SARS-CoV-2 al punt d'atenció en un departament d'emergències
[2] La batalla entre l'amfitrió i el SARS-CoV-2: immunitat innata i estratègies d'evasió viral
Hora de publicació: 25-maig-2022